黑河地区山丘起伏连绵，河流纵横交错，小兴安岭犹如一道绿色的屏障自西北向东南贯穿全市，使地势呈现出中部高、两侧低，北部高、南部低的特点。低山面积17235平方公里，占全区总面积的25.08%，平均海拔在500-900米之间，最高的大黑山海拔867.4米。有丘陵地26990平方公里，占全区总面积的39.27%，海拔在300-500米之间。有火山群16座，占山地密集的1/4，海拔在400-600米之间，以五大连池火山群为最有特色，是全国著名的旅游风景区。全区大体为"六山一水一草二分田"。